Il Consiglio delle scuole universitarie si occupa delle questioni relative ai compiti degli organi responsabili delle scuole universitarie. Ad esempio, emana prescrizioni sui livelli di studio e sui passaggi da un livello all’altro, sulla mobilità e sull’accreditamento. Inoltre, ha il compito di definire le caratteristiche dei diversi tipi di scuola universitaria e garantire il coordinamento della politica universitaria a livello nazionale e la ripartizione dei compiti nei settori con costi particolarmente onerosi. Nel Consiglio sono rappresentati quattordici Cantoni. Esso si riunisce quattro volte all’anno.